まずはProject Explorer のmain/main.collection を開きます。

OutLineにgo(GameObject)がひとつ配置されています。 これがDefoldでのシーンやレベルといったものになります。

新しくスプライトを追加する前に、すでに配置されているスプライトをDeleteキーで削除してしまいます。 その後、新しいGameObjectを右クリックから追加するか、iキーで追加します。

さらに、ｉキーを入力するか右クリックからAddComponentでSpriteコンポーネントを追加します。

追加したSpriteを選択するとPropertiesのImageからatlasを選択し、Default Animationからアトラスの中の画像を選択します。

これでSpriteが配置されました。